Ingénieur bio informaticien H/F

💼 Offre d'emploi

Date de publication

17/07/2025

Dernière mise à jour

17/07/2025

Type de contrat

Contrat à durée indéterminée

Durée de travail

Expérience

Expérience exigée de 2 An(s)

Salaire

Permis demandé

Aucune information

📍 Entreprise

Description de l'offre

[64587] CHU Nantes
Vos missions :
Vous mettez en place des outils d'analyse transcriptomique (RNAseq) adaptés aux leucémies, lymphomes, et autres hémopathies : identification de transcrits de fusion, profils d'expression, SNV, etc. Des essais de plusieurs algorithmes et la création d'un pipeline est attendue avec une sortie annotée et interprétable par les biologistes.
Vous assurez la maîtrise des pipelines d'analyse et leur traçabilité en adéquation avec les exigences de l'ISO 15189 et participez à la démarche d'accréditation des examens biologiques.
Vous contribuez à la traçabilité et à la documentation.
Vous êtes en charge de l'analyse de données de génomique (WES, panels ciblés) dans le cadre du soin et de la recherche.
Vous participez aux projets de recherche et de développement actuellement en cours ou à venir sur l'ADN tumoral circulant, en collaboration avec nos partenaires académiques.
Vous êtes en appui à l'administration du serveur en collaboration avec la Direction des Systèmes Numériques (DSN).
Description du profil recherché:
Diplôme / Formation : Diplôme d'ingénieur, Master 2 ou doctorat (PhD) en bioinformatique
Formations complémentaires requises : Formation ou expérience en analyse NGS, bases de données, développement de pipelines conformes à la norme ISO 15189
Expériences attendues : Minimum 2 ans d'expérience en bioinformatique, idéalement en génomique/transcriptomique humaine
Expérience dans un laboratoire à visée diagnostique appréciée
Horaires : Horaires normaux
Période de la journée : Jour